سكان جنوب السودان لديها خيار لمواصلة التعليم العالي في أي جامعة أو مدرسة مهنية. على الرغم من وجود نقص في كلتا المؤسستين، العديد من البرامج المعمول بها لتوسيع المشهد الحالي للتعليم العالي في جنوب السودان.

المساقات عبارة عن دورس منفردة يمكن دراساتها في الجامعات والكليات والكليات المتوسطة والكليات التجارية في جميع أنحاء العالم. توفر العديد من الكليات دروسا عبر الإنترنت لتوفير مزيد من المرونة للطلاب. يستطيع الطلاب دراسة الدروس المنفردة أو متابعة برامج درجات عبر الإنترنت.